船票一经使用概不接受退票；尚未使用的船票可在开航时间前办理退票并核收手续费。开航后未使用的船票和开航后改签的船票，均不予退票。旅行社用户船票退票规则另行约定，详见《厦门轮渡有限公司旅游客运航线旅行社互联网购票使用须知》。乘客在售票窗口及自助售票机购买的船票，退票须在码头现场办理。
具体退票手续费核收标准：
1.距开航前6天（含）以上退票的，免收手续费。
2.距航班开航时间前48小时（不含）以上办理退票的，按每张船票票价的5%收取退票手续费；
3.距航班开航时间前48小时（含）至24小时（不含）办理退票的，按每张船票票价的10%收取退票手续费；
4.距航班开航时间前24小时（含）以内办理退票的，按每张船票票价的20%收取退票手续费。
具体改签手续费核收标准：
1.距开航前6天（含）以上改签的，免收手续费。
2.距开航前不足6天改签的，手续费按原每张船票票价的5%收取；
3.开航时间前改签的船票，乘客取消订单的，退票手续费按每张船票票价的15%收取；
4.开航时间后改签当日航班的，改签手续费按每张船票票价的20%收取。
5.开航时间后，在当日24时前改签至开航日期之后预售期内航班的， 改签手续费按每张船票票价的30%收取。
上述手续费计算的尾数以5角为单位，尾数小于2.5角的舍去、2.5角（含）以上且小于7.5角的计为5角、7.5角（含）以上的进为1元。
在春运等客运繁忙季节，承运人可以暂停办理退票及改签。